Doujin Work erzählt über das Leben von Najima Osana und ihrem Eintritt in die Welt der Doujins. Nachdem sie bei einer Convention sieht, wie viel Geld eine ihrer Freundinnen damit verdient, beschließt sie ebenfalls Doujins zu zeichnen, muss jedoch schnell herausfinden, dass diese Welt alles andere als einfach ist. Mit der Zeit findet sie immer mehr Freunde, die ihr helfen sich in diese Subkultur einzuleben, was für Najima nicht ohne das Überwinden von vielen Peinlichkeiten möglich ist.