Cuando Jack pregunta a Irina qué es el Pasajero, esta desaparece misteriosamente sin mediar palabra. Jack intenta establecer una nueva comunicación con ella, pero no le resulta posible. Sark trata de obtener la misma información, esta vez de Conrad, con la ayuda de Olivia Reed. Al final ambos toman a Conrad y van a buscar ellos mismos al Pasajero. Vaughn, Jack y Sydney se reúnen en secreto y aquel les informa de lo que ha hallado sobre Lauren. Jack le dice a Vaughn que ha de actuar como si no lo supiera para que puedan obtener información sobre el Consorcio. Pero Vaughn no tiene mucho tiempo para reconciliar sus sentimientos porque la CIA le encarga junto a Sydney que intercepte en el desierto un convoy del Consorcio donde viaja Conrad y sus secuestradores. Desafortunadamente, Sark mata a Conrad cuando este está escapando pero antes de morir, tiene tiempo de decirle a Sydney que no se trata del Pasajero sino de la Pasajera: la hermana de Syd. Aún alucinada por la noticia, Sydney se lo cuenta a su padre y este le informa de que, dado que su madre tuvo una aventura con Sloane, es posible que su hermana sea la hija de ambos. Sydney va a visitar a Sloane a la cárcel y este le dice que se enteró de la existencia de su hija hace dos años (Cuentatrás) y que por eso construyó la Revelación, para obtener su ADN y localizarla a través de su organización médica mundial. Ahora el Consorcio va detrás de ella y Sloane pide a Syd que le ayude a ponerla a salvo. Mientras, la CIA descubre que el Consorcio va detrás de un documento llamado la Restauración que habla de la Pasajera así que Jack elabora un plan para obtenerlo y, a la vez, tenderle una trampa a Lauren que permita desenmascararla. Vaughn y Sydney siguen a Lauren que se reúne con su madre la cual dice a su hija que la Restauración está a salvo en su casa. Con la ayuda de Barnett, la CIA hace que Vaughn viaje con Lauren a casa de su madre para que allí, pueda robar la Restauración. Allí, Vaughn consigue hacer una copia del documento extrayéndolo de la caja fuerte de Olivia aunque casi es sorprendido por Lauren en el proceso. A través del documento descubren que la posición de la Pasajera será revelada por otro artefacto de Rambaldi llamado el Reloj de Arena y que sólo puede ser usado por el padre de la Pasajera, pero Sloane está apenas a unas horas de su ejecución. Jack va a visitar a Sloane y ambos tienen una tensa conversación junto a un vino que trae Jack sobre las deudas del pasado, Irina y sus hijas. Jack advierte a Sloane que lo que este hizo a su hija no es nada comparado con lo que le hará él a la suya. Chinchín. Mientras la ejecución de Sloane tiene lugar, Sydney está en misión secreta para recuperar el Reloj de Arena. Lo consigue y Sloane muere con Dixon, Jack y Lauren de testigos. ¿Sloane muerto? Claro que no. En el depósito de cadáveres, alguien saca el cuerpo de Sloane y le inyecta algo que le devuelve a la vida. Es Jack, el cual puso un misterioso componente en el vino anterior que, combinado con lo inyectado, falsificó la muerte de Sloane primero y permitió regresarle a la vida después. Ahora ambos pueden buscar a la Pasajera...