Lamune nos cuenta la historia de Tomosaka Kenji quien se muda a una ciudad costera cuando aun era muy niño. Al andar conociendo su nueva ciudad, vio que el oleaje del mar, que se iluminaba con el sol de verano parecía como si fuese un enorme mar de limonada. En ese momento conoce a una ni?a muy simpática, de quien se hace amigo (Kokonoe Nanami). Pero no es hasta el otro día que descubre que su vecina es su nueva amiga, quien no solo vive al lado si no que las ventanas de sus cuartos están tan juntos que pueden alcanzar sus brazos. Así va pasando el tiempo haciéndose mas y mas grande su amistad hasta que en el verano del segundo a?o de secundaria esta relación empieza a cambiar.