Les destins de Peter, Nathan et Matt ont été révélés. Une mystérieuse force est apparue, terrassant les Heroes. Alors que les Bennet tentent de vivre le plus normalement du monde, Hiro, propulsé dans le Japon féodal, rencontre son héros : Takezo Kensei. Maya, aidée par son frère Alejandro, essaie de traverser la frontière américaine pour "guérir" de ses dangereux pouvoirs.