1908. L'architecte Shibusawa doit veiller à ce que les plans de reconstruction de Tokyo ne reveillent pas le Masakado. Mais au plus profond de la ville, le diabolique Kato veut asservir l'esprit pour ses propres fins. En utilisant les pouvoirs de l'innocente Yukari, Kato pourrait bien parvenir à détruire la ville et daire de Tokyo la dernière Mégalopolis.