Archer reçoit la visite de Daniels, qui lui apprend que trois Xindi-Reptiles se trouvaient dans le Michigan, à proximité de Detroit, au début du XXIe siècle. Archer et T'Pol décident de faire un saut dans le passé afin de découvrir la raison de leur voyage temporel. Ils découvrent que les Reptiliens utilisent une vieille usine et qu'un homme, répondant au nom de Loomis, travaille pour eux, kidnappant des humains pour leurs expériences. Archer et T'Pol comprennent que leurs ennemis mettent au point une arme biologique nouvelle et que leurs recherches sont presque achevées. Il est temps d'intervenir...