A két kreatív feltaláló, Phineas és Ferb, minden nap más és más tervekkel állnak elő, miközben nővérük, Candace próbálja őket leleplezni anyjuk előtt. Közben párhuzamosan Perry, Phineas és Ferb kacsacsőrűje titkosügynökként kémked Dr. Heinz Doofenshmirtz gonosz zseni után. Vajon sikerül-e Candace-nek leleplezni az öcséit? Vajon Perry meg tudja állítani Doofenshmirtz dokit?