Le Guardiane scoprono di avere ottenuto nuovi poteri: Will può parlare con gli apparecchi elettronici, Irma convince le persone a fare quello che vuole lei, Taranee è telepatica, Cornelia ha poteri di telecinesi e Hay Lin di invisibilità. Nel frattempo, la polizia inizia a indagare sulla scomparsa di Elyon e della sua famiglia, cominciano a sospettare delle W.I.T.C.H., a causa di Miranda che, fingendosi una nuova studentessa, Melinda, dissemina indizi che le incolpano. Rimandati Miranda e Sandpit su Meridian, le ragazze vengono scagionate dal ritorno di Elyon, che ha deciso di terminare l'anno scolastico sulla Terra. Con lei, tornano anche Caleb e Blunk. Susan, la madre di Will, convinta che la figlia non si sia ambientata, decide di trasferirsi in un'altra città.