Kampfpilot Leutnant Kei Katsuragi wird mit einer wichtigen Mission in feindliches Gebiet geschickt: Er soll dort eine neuartige Massenvernichtungswaffe platzieren, die »Raum-/Zeit-Oszillations-Bombe«. Allerdings droht die Bombe bereits vor dem Erreichen des Bestimmungsortes zu detonieren, sodass Kei gezwungen ist, sie zu entschärfen. Es gelingt ihm jedoch nicht und die folgende Explosion führt zu einer Verzerrung des Raum-Zeit-Kontinuums, die Kei in eine andere Dimension schleudert …