Terug in Gotham, vechtend tegen Alice en de Wonderland Gang, blijft Kate Kane worden achtervolgd door de gebeurtenissen rond de dood van haar zus 15 jaar eerder. Terwijl de stad blijft hopen dat Batman is teruggekeerd, proberen Jacob Kane en de Crows de vijandelijke bende neer te halen. Kate blijft op zoek naar de erfenis van Bruce Wayne voor begeleiding, terwijl Luke Fox onbedoeld de vigilante heldhaftigheid van Batwoman binnenhaalt. Sophie en Kate worden gedwongen samen te werken, terwijl Mary zich in het vizier van Alice bevindt.