W wyniku wybuchu bomby siedziba instytutu zostaje zniszczona. Zagrożony przez rząd zespół rozpoczyna działalność w konspiracji. Gwen i jej mąż Rhys muszą uciekać. Dekker przekazuje Frobisherowi tajne plany, dotyczące kosmitów. Współpracownica Frobishera przypadkiem odkrywa na jego biurku dokumenty w sprawie Torchwood. Szef wyjaśnia jej, że Jack jest terrorystą, podejrzanym o spowodowanie eksplozji w instytucie. Wychodzi na jaw, że Gwen spodziewa się dziecka. Lois jest w stanie pomóc ekipie Jacka.